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  ※この記事はYASARA Structure Version.25.9.17 を使用して作成しています。 YASARAのVersion.25.9.17のアップデートに伴い、最上位グレードであるYASARA Structureに Boltz-2 の構造予測プログラムが含まれま...

「RCSB PDB」とは、生体高分子の立体構造の巨大データベースです。

「R因子（R-Value)」とは、 そのタンパク質立体構造が実測構造とどれほど合致するか？ を判断する指標です。

  ChromasPro は、アセンブリや配列編集・解析が可能なソフトです。 今回は、 ChromasPro を使ってプラスミドベクター pBR322 の制限酵素切断地図を作成してみます。 制限酵素切断地図の作成 線形のマップも作成できますが、今回は円形のマップを作成したいの...

   YASARA Tipsのネタがなくなったわけでは全くないのですが，今回は，オープンソースで無償利用可能なDataWarriorのTipsを一つ．

SwissADME は低分子化合物の薬物動態、ドラッグライクネスなどの予測や、様々な物理化学的性質を計算することができる無料のウェブツールです。 スイスの学術的非営利組織である Swiss Institute of Bioinformatics （ SIB ）の Molecu...

タンパク質の重ね合わせの方法はいくつかありますが、今回は「 Superpose 」と「 Align 」の実行例を紹介します。 この記事では、アデノシンデアミナーゼという酵素タンパク質を例に、ヒト（ PDB:3iar ）とマウス（ PDB:1fkw ）のタンパク質の構造を比較し...